Знакомство с направлением, вводная лекция.
Входное тестирование (на усмотрение куратора направления).

Знакомство с разнообразием бактерий, средами обитания, типом роста и патогенностью. Рассмотрим, как культивируют бактерий в лаборатории в минимальных, полных и селективных средах. На практике научимся их готовить и осуществим сбор проб из естественной среды для поиска резистентных бактерий и бактериофагов.

Работа с выделенными бактериальными колониями. Узнаем, как характеризовали и систематизировали разные виды бактерий до развития технологий секвенирования геномов. Рассмотрим, историю открытия и современное разнообразие антибиотиков, механизмы действия и способы приобретения устойчивости. Приготовим бактериальные суспензии и рассмотрим метод дисков диффузии для оценки чувствительности/резистентности к антибиотикам. Проанализируем первые результаты обогащения фаговых лизатов и начнем подготовку к бляшечному тесту.

Познакомимся с тем, кто такие бактериофаги и какие они бывают. Погрузимся в принципы фаговой терапии и познакомимся с методом эффективности бляшкообразования: основного метода оценки инфекционности фагов. Узнаем про разные типы бактериального иммунитета, который защищает клетки от фагов, и как человечество научились использовать его в своих целях: разнообразие рестриктаз и применение технологии CRISPR Cas в современной биоинженерии.

Узнаем о современных методах микроскопии и способах визуализации малых объектов: флуоресцентная микроскопия высокого разрешения, электронная микроскопия и томография. Узнаем о разнообразии методов секвенирования нуклеиновых кислот и современные возможности методов секвенирования третьего поколения: PacBio и ONT. Погрузимся в молекулярную филогенетику.

Рассмотрим основы медицинской микробиологии: типы заболеваний, вызываемых микроорганизмами и способы борьбы с ними. На примере истории распространения Yersinia pestis узнаем, как бактерии становятся патогенными для человека. А также рассмотрим бактериофаг-опосредованную патогенность некоторых клинических штаммов на примере Shigella dysenteriae.

Выходное тестирование (на усмотрение куратора направления).
Защита проекта

Отъезд